Alpagut köyü, tarihi boyunca birçok medeniyete ev sahipliği yapmış ve zengin kültürel miraslarıyla dikkat çekmiştir. Hitit dönemine uzanan kökleri ve Roma dönemine ait kalıntılarıyla, köy, geçmişin izlerini barındırmaktadır. Ayrıca, 20. yüzyılda yaşanan linyit madeni olayı, köyün sosyal ve ekonomik yapısında önemli bir dönüm noktası olmuştur. Bu durum, Alpagut’un tarihsel sürecinin derinliğini ve yerel halkın mücadelelerini gözler önüne sermektedir.

Alpagut köyünün tarihi hakkında bilinen bazı bilgiler şunlardır:

• Adın kökeni: Köyün adı Türkçe bir oymak adı olabilir.
• Antik dönem izleri: Köyde, Hitit döneminden kalma kaya resimleri ve Roma döneminden kalma antik bir köprü bulunmaktadır.
• Linyit madeni olayı: 1969 yılında, Alpagut Linyit İşletmesi'nde işçiler, ücretlerinin ödenmemesi ve kötü çalışma koşulları nedeniyle işletmeyi işgal etmiştir.
• Osmanlı kayıtları: 1530 yılı muhasebe defterinde Alpagut köyünden bahsedilmemektedir, ancak daha sonraki Osmanlı kayıtlarında köy mevcuttur. Bu durum, 1530 yılında Kastamonu'daki Alpagut adındaki Türkmen cemaatinden kopan bir kolun buraya gelmiş olabileceğini düşündürmektedir.

Ayrıca, Alpagut köyünde, Roma döneminde önemli bir kasaba olduğunu gösteren höyükler ve tümülüsler de bulunmaktadır.