Aktopraklık Höyüğü, tarih öncesi dönemlerin derinliklerine işaret eden önemli bir yerleşim alanıdır. Bu bölge, insanlığın yerleşik hayata geçiş sürecinin izlerini taşırken, tarımın ilk örneklerine ev sahipliği yapmasıyla da büyük bir önem arz eder. Arkeolojik buluntular, höyüğün sadece bir yerleşim yeri olmadığını, aynı zamanda tarımın kökenlerinin araştırıldığı bir merkez olduğunu gösterir. Ziyaretçilere sunduğu açık hava müzesi deneyimi ile de geçmişe yolculuk yapmayı mümkün kılar.

Aktopraklık Höyüğü'nün tarihi önemi şu şekilde özetlenebilir:

• Yerleşik yaşamın başlangıcı: Höyük, günümüzden yaklaşık 8500 yıl önce yerleşilen ve bin yıl kadar kesintisiz yerleşimin devam ettiği Bursa'nın en eski yerleşimlerinden biridir.
• Tarımın kökeni: Batı Anadolu'da ekili tarımın 8 bin yıllık geçmişini sergiler ve bu tarımın batıya doğru Aktopraklık'tan yayıldığı düşünülmektedir.
• Arkeolojik kanıtlar: Kazılarda en az 8 yerleşim katının varlığı tespit edilmiş olup, özellikle hendekle çevrili yerleşim katmanları, Anadolu tarihöncesi mimarlık ve yerleşim düzeni konularında benzersiz bir örnek teşkil etmektedir.
• Açık hava müzesi: Kazılarda ortaya çıkarılan kalıntılar, bir açık hava müzesi olarak sergilenmekte ve ziyaretçilere uygulamalı etkinliklerle tarihöncesi yaşam tanıtılmaktadır.
• Eğitim ve araştırma: Bir "Arkeoloji Okulu" olarak da işlev görmekte ve her yıl düzenlenen atölyelerde öğrenciler ve araştırmacılar için eğitim programları sunulmaktadır.